Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCL3L1P16619 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.1 ms