Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACADSP16219 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACADSP16219 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACADSP16219 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACADSP16219 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACADSP16219 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACADSP16219 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACADSP16219 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACADSP16219 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACADSP16219 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ACADSP16219 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACADSP16219 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACADSP16219 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACADSP16219 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACADSP16219 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACADSP16219 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACADSP16219 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACADSP16219 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACADSP16219 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACADSP16219 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACADSP16219 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACADSP16219 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACADSP16219 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACADSP16219 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACADSP16219 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACADSP16219 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACADSP16219 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ACADSP16219 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACADSP16219 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ACADSP16219 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACADSP16219 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACADSP16219 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACADSP16219 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACADSP16219 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACADSP16219 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACADSP16219 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACADSP16219 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACADSP16219 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACADSP16219 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACADSP16219 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACADSP16219 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACADSP16219 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACADSP16219 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACADSP16219 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACADSP16219 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ACADSP16219 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACADSP16219 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACADSP16219 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACADSP16219 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACADSP16219 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACADSP16219 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACADSP16219 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACADSP16219 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACADSP16219 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACADSP16219 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACADSP16219 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ACADSP16219 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACADSP16219 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACADSP16219 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACADSP16219 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACADSP16219 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACADSP16219 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACADSP16219 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACADSP16219 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACADSP16219 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACADSP16219 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACADSP16219 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACADSP16219 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACADSP16219 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACADSP16219 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACADSP16219 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACADSP16219 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACADSP16219 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACADSP16219 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACADSP16219 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACADSP16219 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACADSP16219 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACADSP16219 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACADSP16219 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACADSP16219 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACADSP16219 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACADSP16219 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACADSP16219 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACADSP16219 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACADSP16219 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACADSP16219 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACADSP16219 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACADSP16219 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACADSP16219 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACADSP16219 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACADSP16219 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACADSP16219 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACADSP16219 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACADSP16219 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACADSP16219 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACADSP16219 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACADSP16219 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACADSP16219 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACADSP16219 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACADSP16219 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms