Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DSPP15924 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
DSPP15924 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSPP15924 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSPP15924 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSPP15924 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSPP15924 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSPP15924 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
DSPP15924 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSPP15924 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
DSPP15924 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSPP15924 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSPP15924 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSPP15924 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSPP15924 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
DSPP15924 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSPP15924 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSPP15924 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
DSPP15924 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSPP15924 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSPP15924 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSPP15924 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSPP15924 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSPP15924 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSPP15924 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSPP15924 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSPP15924 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSPP15924 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSPP15924 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSPP15924 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSPP15924 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSPP15924 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSPP15924 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSPP15924 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSPP15924 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSPP15924 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSPP15924 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSPP15924 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DSPP15924 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DSPP15924 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DSPP15924 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DSPP15924 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DSPP15924 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DSPP15924 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DSPP15924 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DSPP15924 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DSPP15924 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
DSPP15924 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DSPP15924 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DSPP15924 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DSPP15924 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DSPP15924 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DSPP15924 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DSPP15924 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DSPP15924 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DSPP15924 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DSPP15924 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DSPP15924 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
DSPP15924 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DSPP15924 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DSPP15924 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DSPP15924 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DSPP15924 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DSPP15924 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DSPP15924 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DSPP15924 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DSPP15924 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DSPP15924 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.94
DSPP15924 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DSPP15924 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DSPP15924 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DSPP15924 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DSPP15924 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DSPP15924 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DSPP15924 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DSPP15924 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSPP15924 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSPP15924 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSPP15924 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
DSPP15924 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSPP15924 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSPP15924 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSPP15924 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSPP15924 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DSPP15924 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSPP15924 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSPP15924 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
DSPP15924 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
DSPP15924 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSPP15924 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
DSPP15924 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSPP15924 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSPP15924 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSPP15924 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSPP15924 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSPP15924 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSPP15924 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSPP15924 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSPP15924 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DSPP15924 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms