Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
VAV1P15498 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAV1P15498 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAV1P15498 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAV1P15498 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAV1P15498 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAV1P15498 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAV1P15498 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAV1P15498 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAV1P15498 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAV1P15498 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAV1P15498 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAV1P15498 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAV1P15498 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAV1P15498 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAV1P15498 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAV1P15498 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VAV1P15498 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAV1P15498 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAV1P15498 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAV1P15498 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAV1P15498 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAV1P15498 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAV1P15498 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAV1P15498 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAV1P15498 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAV1P15498 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAV1P15498 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAV1P15498 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAV1P15498 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAV1P15498 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAV1P15498 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAV1P15498 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
VAV1P15498 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAV1P15498 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAV1P15498 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAV1P15498 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAV1P15498 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAV1P15498 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAV1P15498 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAV1P15498 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VAV1P15498 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAV1P15498 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAV1P15498 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAV1P15498 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAV1P15498 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAV1P15498 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAV1P15498 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAV1P15498 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAV1P15498 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAV1P15498 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAV1P15498 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAV1P15498 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAV1P15498 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAV1P15498 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAV1P15498 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAV1P15498 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VAV1P15498 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAV1P15498 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAV1P15498 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAV1P15498 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAV1P15498 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAV1P15498 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAV1P15498 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAV1P15498 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAV1P15498 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAV1P15498 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAV1P15498 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAV1P15498 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAV1P15498 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VAV1P15498 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VAV1P15498 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VAV1P15498 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VAV1P15498 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAV1P15498 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAV1P15498 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAV1P15498 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAV1P15498 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAV1P15498 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAV1P15498 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAV1P15498 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAV1P15498 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAV1P15498 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAV1P15498 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAV1P15498 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAV1P15498 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAV1P15498 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAV1P15498 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAV1P15498 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAV1P15498 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAV1P15498 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAV1P15498 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAV1P15498 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAV1P15498 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAV1P15498 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAV1P15498 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAV1P15498 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAV1P15498 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAV1P15498 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAV1P15498 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms