Protein–RNA interactions for Protein: P15172

MYOD1, Myoblast determination protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOD1P15172 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MYOD1P15172 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms