Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
GABRA1P14867 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms