Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRIM27P14373 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM27P14373 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM27P14373 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM27P14373 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM27P14373 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM27P14373 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM27P14373 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM27P14373 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM27P14373 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM27P14373 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM27P14373 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM27P14373 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM27P14373 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM27P14373 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM27P14373 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM27P14373 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM27P14373 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM27P14373 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM27P14373 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM27P14373 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM27P14373 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM27P14373 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM27P14373 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM27P14373 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM27P14373 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM27P14373 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM27P14373 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM27P14373 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM27P14373 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM27P14373 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM27P14373 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM27P14373 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM27P14373 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM27P14373 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM27P14373 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM27P14373 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM27P14373 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM27P14373 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM27P14373 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM27P14373 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM27P14373 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM27P14373 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM27P14373 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM27P14373 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms