Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT13P13646 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT13P13646 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT13P13646 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT13P13646 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT13P13646 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT13P13646 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT13P13646 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT13P13646 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT13P13646 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT13P13646 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT13P13646 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT13P13646 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT13P13646 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT13P13646 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT13P13646 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT13P13646 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT13P13646 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT13P13646 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT13P13646 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT13P13646 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT13P13646 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT13P13646 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT13P13646 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT13P13646 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT13P13646 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT13P13646 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT13P13646 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT13P13646 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT13P13646 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT13P13646 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT13P13646 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT13P13646 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT13P13646 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT13P13646 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT13P13646 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT13P13646 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT13P13646 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT13P13646 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT13P13646 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT13P13646 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT13P13646 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT13P13646 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT13P13646 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT13P13646 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT13P13646 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT13P13646 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT13P13646 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT13P13646 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT13P13646 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT13P13646 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT13P13646 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT13P13646 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT13P13646 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT13P13646 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT13P13646 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT13P13646 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT13P13646 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT13P13646 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT13P13646 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT13P13646 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT13P13646 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT13P13646 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT13P13646 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT13P13646 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT13P13646 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT13P13646 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT13P13646 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT13P13646 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT13P13646 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT13P13646 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT13P13646 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT13P13646 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT13P13646 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT13P13646 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT13P13646 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT13P13646 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT13P13646 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT13P13646 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT13P13646 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT13P13646 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT13P13646 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT13P13646 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT13P13646 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT13P13646 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT13P13646 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT13P13646 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT13P13646 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT13P13646 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT13P13646 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT13P13646 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT13P13646 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT13P13646 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT13P13646 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT13P13646 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT13P13646 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT13P13646 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT13P13646 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT13P13646 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT13P13646 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms