Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM1P13164 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM1P13164 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM1P13164 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM1P13164 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM1P13164 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM1P13164 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM1P13164 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM1P13164 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM1P13164 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM1P13164 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM1P13164 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
IFITM1P13164 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IFITM1P13164 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
IFITM1P13164 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IFITM1P13164 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IFITM1P13164 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
IFITM1P13164 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
IFITM1P13164 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM1P13164 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM1P13164 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM1P13164 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM1P13164 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM1P13164 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM1P13164 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM1P13164 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM1P13164 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM1P13164 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM1P13164 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM1P13164 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IFITM1P13164 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM1P13164 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM1P13164 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IFITM1P13164 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM1P13164 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM1P13164 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM1P13164 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM1P13164 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM1P13164 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM1P13164 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM1P13164 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM1P13164 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM1P13164 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM1P13164 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM1P13164 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM1P13164 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM1P13164 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM1P13164 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM1P13164 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM1P13164 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IFITM1P13164 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms