Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRF1P10914 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRF1P10914 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRF1P10914 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRF1P10914 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRF1P10914 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRF1P10914 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF1P10914 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF1P10914 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF1P10914 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF1P10914 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF1P10914 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF1P10914 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF1P10914 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF1P10914 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF1P10914 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF1P10914 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF1P10914 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF1P10914 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF1P10914 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF1P10914 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF1P10914 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF1P10914 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF1P10914 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF1P10914 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF1P10914 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF1P10914 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF1P10914 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF1P10914 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF1P10914 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF1P10914 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF1P10914 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF1P10914 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF1P10914 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF1P10914 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF1P10914 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF1P10914 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRF1P10914 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRF1P10914 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRF1P10914 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF1P10914 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF1P10914 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF1P10914 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF1P10914 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF1P10914 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF1P10914 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF1P10914 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF1P10914 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF1P10914 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF1P10914 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF1P10914 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF1P10914 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF1P10914 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF1P10914 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF1P10914 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF1P10914 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF1P10914 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF1P10914 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF1P10914 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF1P10914 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF1P10914 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF1P10914 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF1P10914 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF1P10914 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF1P10914 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF1P10914 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF1P10914 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF1P10914 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF1P10914 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF1P10914 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF1P10914 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF1P10914 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF1P10914 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF1P10914 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF1P10914 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF1P10914 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF1P10914 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF1P10914 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF1P10914 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF1P10914 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF1P10914 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF1P10914 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF1P10914 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF1P10914 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF1P10914 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF1P10914 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF1P10914 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF1P10914 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF1P10914 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF1P10914 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF1P10914 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF1P10914 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF1P10914 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF1P10914 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF1P10914 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF1P10914 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF1P10914 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF1P10914 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF1P10914 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF1P10914 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms