Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CD28P10747 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD28P10747 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD28P10747 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD28P10747 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD28P10747 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD28P10747 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD28P10747 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD28P10747 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD28P10747 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD28P10747 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD28P10747 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD28P10747 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD28P10747 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD28P10747 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD28P10747 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD28P10747 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD28P10747 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD28P10747 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD28P10747 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD28P10747 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD28P10747 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD28P10747 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD28P10747 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD28P10747 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD28P10747 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD28P10747 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD28P10747 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD28P10747 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD28P10747 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD28P10747 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD28P10747 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD28P10747 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD28P10747 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD28P10747 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD28P10747 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD28P10747 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD28P10747 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD28P10747 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD28P10747 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD28P10747 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD28P10747 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD28P10747 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD28P10747 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD28P10747 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD28P10747 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CD28P10747 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD28P10747 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD28P10747 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD28P10747 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD28P10747 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD28P10747 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD28P10747 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD28P10747 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD28P10747 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD28P10747 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD28P10747 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD28P10747 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD28P10747 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD28P10747 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD28P10747 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD28P10747 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD28P10747 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD28P10747 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD28P10747 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD28P10747 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD28P10747 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD28P10747 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD28P10747 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD28P10747 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD28P10747 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD28P10747 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD28P10747 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD28P10747 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD28P10747 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD28P10747 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD28P10747 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD28P10747 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD28P10747 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD28P10747 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CD28P10747 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CD28P10747 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD28P10747 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD28P10747 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD28P10747 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD28P10747 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD28P10747 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD28P10747 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD28P10747 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD28P10747 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD28P10747 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD28P10747 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD28P10747 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD28P10747 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CD28P10747 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD28P10747 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD28P10747 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CD28P10747 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD28P10747 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD28P10747 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms