Protein–RNA interactions for Protein: P10745

RBP3, Retinol-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP3P10745 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBP3P10745 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBP3P10745 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBP3P10745 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBP3P10745 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBP3P10745 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBP3P10745 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBP3P10745 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBP3P10745 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBP3P10745 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBP3P10745 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBP3P10745 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBP3P10745 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBP3P10745 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBP3P10745 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBP3P10745 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBP3P10745 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBP3P10745 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBP3P10745 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBP3P10745 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBP3P10745 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBP3P10745 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBP3P10745 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBP3P10745 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBP3P10745 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBP3P10745 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBP3P10745 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP3P10745 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP3P10745 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP3P10745 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP3P10745 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP3P10745 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP3P10745 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP3P10745 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP3P10745 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP3P10745 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP3P10745 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP3P10745 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP3P10745 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RBP3P10745 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBP3P10745 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBP3P10745 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBP3P10745 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBP3P10745 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBP3P10745 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBP3P10745 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBP3P10745 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RBP3P10745 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBP3P10745 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBP3P10745 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBP3P10745 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RBP3P10745 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBP3P10745 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBP3P10745 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBP3P10745 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBP3P10745 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBP3P10745 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBP3P10745 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBP3P10745 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBP3P10745 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBP3P10745 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBP3P10745 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBP3P10745 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBP3P10745 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBP3P10745 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RBP3P10745 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBP3P10745 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBP3P10745 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBP3P10745 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBP3P10745 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBP3P10745 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBP3P10745 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBP3P10745 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBP3P10745 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBP3P10745 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBP3P10745 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RBP3P10745 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RBP3P10745 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBP3P10745 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBP3P10745 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBP3P10745 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBP3P10745 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBP3P10745 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBP3P10745 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBP3P10745 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBP3P10745 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBP3P10745 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBP3P10745 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBP3P10745 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBP3P10745 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RBP3P10745 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBP3P10745 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBP3P10745 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RBP3P10745 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBP3P10745 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBP3P10745 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RBP3P10745 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBP3P10745 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBP3P10745 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBP3P10745 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms