Protein–RNA interactions for Protein: P10643

C7, Complement component C7, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7P10643 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C7P10643 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C7P10643 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C7P10643 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C7P10643 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C7P10643 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C7P10643 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C7P10643 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C7P10643 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C7P10643 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C7P10643 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C7P10643 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C7P10643 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C7P10643 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C7P10643 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C7P10643 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C7P10643 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C7P10643 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C7P10643 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C7P10643 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C7P10643 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C7P10643 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C7P10643 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C7P10643 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C7P10643 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C7P10643 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C7P10643 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C7P10643 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C7P10643 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C7P10643 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C7P10643 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C7P10643 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C7P10643 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C7P10643 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C7P10643 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C7P10643 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C7P10643 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C7P10643 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C7P10643 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C7P10643 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C7P10643 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C7P10643 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C7P10643 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C7P10643 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C7P10643 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C7P10643 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C7P10643 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C7P10643 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C7P10643 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C7P10643 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C7P10643 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C7P10643 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C7P10643 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C7P10643 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C7P10643 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C7P10643 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C7P10643 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C7P10643 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C7P10643 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C7P10643 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C7P10643 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C7P10643 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C7P10643 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C7P10643 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C7P10643 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C7P10643 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C7P10643 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C7P10643 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C7P10643 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C7P10643 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C7P10643 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C7P10643 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C7P10643 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C7P10643 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C7P10643 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C7P10643 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C7P10643 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C7P10643 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C7P10643 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C7P10643 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C7P10643 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C7P10643 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C7P10643 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C7P10643 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C7P10643 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C7P10643 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C7P10643 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C7P10643 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C7P10643 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C7P10643 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C7P10643 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C7P10643 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C7P10643 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C7P10643 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C7P10643 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C7P10643 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C7P10643 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C7P10643 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C7P10643 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C7P10643 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms