Protein–RNA interactions for Protein: P10600

TGFB3, Transforming growth factor beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB3P10600 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TGFB3P10600 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TGFB3P10600 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms