Protein–RNA interactions for Protein: P10451

SPP1, Osteopontin, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPP1P10451 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPP1P10451 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPP1P10451 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPP1P10451 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPP1P10451 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPP1P10451 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPP1P10451 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPP1P10451 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPP1P10451 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPP1P10451 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPP1P10451 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPP1P10451 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPP1P10451 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPP1P10451 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPP1P10451 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPP1P10451 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPP1P10451 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPP1P10451 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPP1P10451 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPP1P10451 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPP1P10451 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPP1P10451 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPP1P10451 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPP1P10451 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPP1P10451 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPP1P10451 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPP1P10451 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPP1P10451 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPP1P10451 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPP1P10451 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPP1P10451 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPP1P10451 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPP1P10451 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPP1P10451 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPP1P10451 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPP1P10451 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPP1P10451 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPP1P10451 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPP1P10451 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPP1P10451 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPP1P10451 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPP1P10451 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPP1P10451 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPP1P10451 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPP1P10451 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPP1P10451 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPP1P10451 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPP1P10451 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPP1P10451 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPP1P10451 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPP1P10451 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPP1P10451 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPP1P10451 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPP1P10451 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPP1P10451 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPP1P10451 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPP1P10451 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPP1P10451 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SPP1P10451 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPP1P10451 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPP1P10451 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPP1P10451 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPP1P10451 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPP1P10451 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SPP1P10451 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SPP1P10451 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SPP1P10451 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPP1P10451 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPP1P10451 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPP1P10451 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPP1P10451 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPP1P10451 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPP1P10451 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPP1P10451 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPP1P10451 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPP1P10451 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPP1P10451 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPP1P10451 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SPP1P10451 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPP1P10451 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SPP1P10451 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SPP1P10451 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPP1P10451 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPP1P10451 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPP1P10451 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPP1P10451 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPP1P10451 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPP1P10451 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPP1P10451 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPP1P10451 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPP1P10451 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SPP1P10451 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPP1P10451 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPP1P10451 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPP1P10451 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPP1P10451 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPP1P10451 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPP1P10451 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPP1P10451 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPP1P10451 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms