Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GLI4P10075 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GLI4P10075 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GLI4P10075 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GLI4P10075 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GLI4P10075 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GLI4P10075 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GLI4P10075 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GLI4P10075 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GLI4P10075 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GLI4P10075 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GLI4P10075 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GLI4P10075 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GLI4P10075 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GLI4P10075 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GLI4P10075 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GLI4P10075 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GLI4P10075 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GLI4P10075 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GLI4P10075 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GLI4P10075 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GLI4P10075 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GLI4P10075 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GLI4P10075 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GLI4P10075 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GLI4P10075 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GLI4P10075 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GLI4P10075 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GLI4P10075 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GLI4P10075 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GLI4P10075 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GLI4P10075 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GLI4P10075 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GLI4P10075 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GLI4P10075 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GLI4P10075 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GLI4P10075 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GLI4P10075 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GLI4P10075 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GLI4P10075 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GLI4P10075 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GLI4P10075 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GLI4P10075 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GLI4P10075 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GLI4P10075 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GLI4P10075 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GLI4P10075 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GLI4P10075 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GLI4P10075 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GLI4P10075 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GLI4P10075 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GLI4P10075 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GLI4P10075 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GLI4P10075 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GLI4P10075 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GLI4P10075 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GLI4P10075 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GLI4P10075 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GLI4P10075 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GLI4P10075 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GLI4P10075 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GLI4P10075 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GLI4P10075 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GLI4P10075 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GLI4P10075 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GLI4P10075 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GLI4P10075 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GLI4P10075 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GLI4P10075 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GLI4P10075 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GLI4P10075 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GLI4P10075 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GLI4P10075 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GLI4P10075 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GLI4P10075 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GLI4P10075 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GLI4P10075 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GLI4P10075 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GLI4P10075 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GLI4P10075 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GLI4P10075 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GLI4P10075 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GLI4P10075 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GLI4P10075 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GLI4P10075 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GLI4P10075 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GLI4P10075 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GLI4P10075 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GLI4P10075 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GLI4P10075 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GLI4P10075 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GLI4P10075 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GLI4P10075 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GLI4P10075 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GLI4P10075 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GLI4P10075 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GLI4P10075 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GLI4P10075 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GLI4P10075 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GLI4P10075 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms