Protein–RNA interactions for Protein: P0DP25

CALM3, Calmodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM3P0DP25 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CALM3P0DP25 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CALM3P0DP25 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CALM3P0DP25 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CALM3P0DP25 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CALM3P0DP25 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CALM3P0DP25 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CALM3P0DP25 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CALM3P0DP25 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CALM3P0DP25 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CALM3P0DP25 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CALM3P0DP25 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALM3P0DP25 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALM3P0DP25 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALM3P0DP25 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALM3P0DP25 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALM3P0DP25 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALM3P0DP25 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALM3P0DP25 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALM3P0DP25 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALM3P0DP25 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALM3P0DP25 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALM3P0DP25 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CALM3P0DP25 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CALM3P0DP25 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CALM3P0DP25 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CALM3P0DP25 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CALM3P0DP25 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CALM3P0DP25 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CALM3P0DP25 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALM3P0DP25 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALM3P0DP25 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALM3P0DP25 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALM3P0DP25 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CALM3P0DP25 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALM3P0DP25 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CALM3P0DP25 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CALM3P0DP25 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CALM3P0DP25 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CALM3P0DP25 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CALM3P0DP25 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms