Protein–RNA interactions for Protein: P0DME0

SETSIP, Protein SETSIP, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETSIPP0DME0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETSIPP0DME0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETSIPP0DME0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms