Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf88P0DMB2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms