Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
HOXB7P09629 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HOXB7P09629 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HOXB7P09629 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HOXB7P09629 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
HOXB7P09629 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HOXB7P09629 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HOXB7P09629 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HOXB7P09629 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
HOXB7P09629 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HOXB7P09629 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HOXB7P09629 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HOXB7P09629 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HOXB7P09629 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms