Protein–RNA interactions for Protein: P08684

CYP3A4, Cytochrome P450 3A4, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP3A4P08684 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP3A4P08684 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP3A4P08684 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP3A4P08684 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP3A4P08684 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP3A4P08684 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP3A4P08684 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP3A4P08684 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP3A4P08684 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP3A4P08684 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP3A4P08684 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP3A4P08684 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP3A4P08684 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP3A4P08684 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP3A4P08684 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP3A4P08684 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP3A4P08684 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP3A4P08684 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP3A4P08684 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP3A4P08684 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP3A4P08684 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP3A4P08684 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CYP3A4P08684 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP3A4P08684 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP3A4P08684 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP3A4P08684 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP3A4P08684 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP3A4P08684 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP3A4P08684 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP3A4P08684 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP3A4P08684 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP3A4P08684 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP3A4P08684 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP3A4P08684 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP3A4P08684 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP3A4P08684 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP3A4P08684 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP3A4P08684 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP3A4P08684 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP3A4P08684 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP3A4P08684 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms