Protein–RNA interactions for Protein: P08493

MGP, Matrix Gla protein, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGPP08493 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MGPP08493 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MGPP08493 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MGPP08493 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MGPP08493 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MGPP08493 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MGPP08493 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MGPP08493 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MGPP08493 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MGPP08493 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MGPP08493 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MGPP08493 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MGPP08493 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MGPP08493 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MGPP08493 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MGPP08493 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MGPP08493 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MGPP08493 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MGPP08493 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MGPP08493 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MGPP08493 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MGPP08493 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MGPP08493 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MGPP08493 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MGPP08493 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MGPP08493 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MGPP08493 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MGPP08493 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MGPP08493 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MGPP08493 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MGPP08493 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MGPP08493 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MGPP08493 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MGPP08493 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MGPP08493 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MGPP08493 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MGPP08493 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MGPP08493 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MGPP08493 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MGPP08493 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MGPP08493 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MGPP08493 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MGPP08493 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MGPP08493 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MGPP08493 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MGPP08493 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MGPP08493 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MGPP08493 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MGPP08493 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MGPP08493 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MGPP08493 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MGPP08493 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MGPP08493 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MGPP08493 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MGPP08493 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MGPP08493 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MGPP08493 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MGPP08493 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MGPP08493 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MGPP08493 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MGPP08493 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MGPP08493 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MGPP08493 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MGPP08493 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MGPP08493 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MGPP08493 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MGPP08493 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MGPP08493 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MGPP08493 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MGPP08493 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MGPP08493 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MGPP08493 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MGPP08493 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MGPP08493 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MGPP08493 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MGPP08493 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MGPP08493 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MGPP08493 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MGPP08493 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MGPP08493 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MGPP08493 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MGPP08493 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MGPP08493 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MGPP08493 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MGPP08493 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MGPP08493 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MGPP08493 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MGPP08493 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MGPP08493 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MGPP08493 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MGPP08493 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MGPP08493 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MGPP08493 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MGPP08493 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MGPP08493 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MGPP08493 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MGPP08493 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MGPP08493 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MGPP08493 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MGPP08493 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms