Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NEFMP07197 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NEFMP07197 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NEFMP07197 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NEFMP07197 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NEFMP07197 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NEFMP07197 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NEFMP07197 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NEFMP07197 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEFMP07197 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEFMP07197 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEFMP07197 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
NEFMP07197 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEFMP07197 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
NEFMP07197 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
NEFMP07197 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEFMP07197 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEFMP07197 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEFMP07197 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEFMP07197 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEFMP07197 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEFMP07197 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
NEFMP07197 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEFMP07197 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEFMP07197 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEFMP07197 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEFMP07197 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEFMP07197 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEFMP07197 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEFMP07197 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEFMP07197 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
NEFMP07197 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEFMP07197 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEFMP07197 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEFMP07197 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEFMP07197 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NEFMP07197 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NEFMP07197 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
NEFMP07197 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
NEFMP07197 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
NEFMP07197 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
NEFMP07197 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NEFMP07197 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NEFMP07197 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NEFMP07197 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NEFMP07197 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NEFMP07197 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NEFMP07197 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NEFMP07197 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NEFMP07197 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
NEFMP07197 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NEFMP07197 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NEFMP07197 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NEFMP07197 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NEFMP07197 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NEFMP07197 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NEFMP07197 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NEFMP07197 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NEFMP07197 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NEFMP07197 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NEFMP07197 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NEFMP07197 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NEFMP07197 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NEFMP07197 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
NEFMP07197 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NEFMP07197 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NEFMP07197 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NEFMP07197 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NEFMP07197 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
NEFMP07197 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEFMP07197 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEFMP07197 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEFMP07197 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEFMP07197 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEFMP07197 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEFMP07197 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEFMP07197 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEFMP07197 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEFMP07197 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEFMP07197 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEFMP07197 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEFMP07197 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NEFMP07197 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NEFMP07197 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NEFMP07197 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NEFMP07197 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NEFMP07197 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NEFMP07197 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NEFMP07197 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NEFMP07197 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NEFMP07197 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NEFMP07197 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NEFMP07197 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NEFMP07197 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NEFMP07197 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NEFMP07197 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NEFMP07197 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NEFMP07197 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEFMP07197 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEFMP07197 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms