Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOA4P06727 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOA4P06727 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOA4P06727 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOA4P06727 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOA4P06727 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOA4P06727 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOA4P06727 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOA4P06727 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOA4P06727 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOA4P06727 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA4P06727 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA4P06727 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA4P06727 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA4P06727 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA4P06727 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA4P06727 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA4P06727 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA4P06727 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA4P06727 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA4P06727 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA4P06727 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA4P06727 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOA4P06727 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOA4P06727 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOA4P06727 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOA4P06727 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOA4P06727 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
APOA4P06727 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOA4P06727 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOA4P06727 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOA4P06727 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOA4P06727 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOA4P06727 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOA4P06727 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOA4P06727 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOA4P06727 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOA4P06727 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOA4P06727 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOA4P06727 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
APOA4P06727 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOA4P06727 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOA4P06727 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOA4P06727 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOA4P06727 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOA4P06727 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOA4P06727 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOA4P06727 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOA4P06727 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOA4P06727 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOA4P06727 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOA4P06727 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOA4P06727 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOA4P06727 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOA4P06727 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOA4P06727 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOA4P06727 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOA4P06727 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOA4P06727 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOA4P06727 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOA4P06727 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOA4P06727 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOA4P06727 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOA4P06727 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOA4P06727 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOA4P06727 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOA4P06727 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOA4P06727 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOA4P06727 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOA4P06727 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOA4P06727 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOA4P06727 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOA4P06727 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOA4P06727 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOA4P06727 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
APOA4P06727 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
APOA4P06727 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOA4P06727 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOA4P06727 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOA4P06727 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOA4P06727 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOA4P06727 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
APOA4P06727 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
APOA4P06727 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
APOA4P06727 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
APOA4P06727 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOA4P06727 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOA4P06727 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOA4P06727 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOA4P06727 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
APOA4P06727 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOA4P06727 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOA4P06727 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOA4P06727 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOA4P06727 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOA4P06727 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOA4P06727 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
APOA4P06727 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOA4P06727 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
APOA4P06727 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms