Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNA4P05014 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNA4P05014 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms