Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1RP00736 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
C1RP00736 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1RP00736 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
C1RP00736 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
C1RP00736 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
C1RP00736 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
C1RP00736 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
C1RP00736 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
C1RP00736 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1RP00736 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1RP00736 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1RP00736 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1RP00736 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1RP00736 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1RP00736 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1RP00736 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1RP00736 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1RP00736 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1RP00736 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1RP00736 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1RP00736 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1RP00736 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1RP00736 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1RP00736 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1RP00736 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1RP00736 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1RP00736 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1RP00736 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1RP00736 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
C1RP00736 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1RP00736 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1RP00736 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1RP00736 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1RP00736 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1RP00736 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1RP00736 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1RP00736 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1RP00736 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1RP00736 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1RP00736 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1RP00736 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1RP00736 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C1RP00736 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1RP00736 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1RP00736 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1RP00736 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1RP00736 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1RP00736 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1RP00736 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1RP00736 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1RP00736 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1RP00736 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1RP00736 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1RP00736 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1RP00736 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1RP00736 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1RP00736 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1RP00736 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1RP00736 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1RP00736 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1RP00736 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1RP00736 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1RP00736 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1RP00736 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1RP00736 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1RP00736 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1RP00736 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C1RP00736 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
C1RP00736 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1RP00736 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1RP00736 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1RP00736 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1RP00736 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1RP00736 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
C1RP00736 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1RP00736 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1RP00736 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1RP00736 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1RP00736 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C1RP00736 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1RP00736 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1RP00736 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1RP00736 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1RP00736 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1RP00736 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1RP00736 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1RP00736 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1RP00736 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C1RP00736 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1RP00736 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1RP00736 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C1RP00736 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C1RP00736 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1RP00736 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C1RP00736 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1RP00736 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1RP00736 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1RP00736 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1RP00736 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1113.8 ms