Protein–RNA interactions for Protein: P00480

OTC, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTCP00480 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTCP00480 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTCP00480 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTCP00480 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTCP00480 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
OTCP00480 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
OTCP00480 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTCP00480 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTCP00480 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTCP00480 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
OTCP00480 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTCP00480 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTCP00480 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTCP00480 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTCP00480 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTCP00480 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTCP00480 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTCP00480 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
OTCP00480 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTCP00480 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTCP00480 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTCP00480 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTCP00480 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTCP00480 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTCP00480 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTCP00480 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTCP00480 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTCP00480 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTCP00480 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTCP00480 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTCP00480 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTCP00480 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTCP00480 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTCP00480 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTCP00480 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTCP00480 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTCP00480 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTCP00480 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTCP00480 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTCP00480 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTCP00480 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
OTCP00480 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTCP00480 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTCP00480 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTCP00480 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTCP00480 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTCP00480 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTCP00480 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTCP00480 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTCP00480 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTCP00480 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTCP00480 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTCP00480 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTCP00480 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTCP00480 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTCP00480 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTCP00480 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTCP00480 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTCP00480 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
OTCP00480 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTCP00480 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTCP00480 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTCP00480 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTCP00480 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTCP00480 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTCP00480 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTCP00480 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTCP00480 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
OTCP00480 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
OTCP00480 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
OTCP00480 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
OTCP00480 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
OTCP00480 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
OTCP00480 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
OTCP00480 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTCP00480 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTCP00480 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTCP00480 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTCP00480 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTCP00480 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTCP00480 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTCP00480 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTCP00480 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTCP00480 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTCP00480 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTCP00480 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTCP00480 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTCP00480 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTCP00480 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTCP00480 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTCP00480 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTCP00480 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTCP00480 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
OTCP00480 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTCP00480 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
OTCP00480 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTCP00480 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
OTCP00480 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTCP00480 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTCP00480 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms