Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOP3BO95985 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP3BO95985 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms