Protein–RNA interactions for Protein: O95935

TBX18, T-box transcription factor TBX18, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX18O95935 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBX18O95935 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBX18O95935 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBX18O95935 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBX18O95935 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBX18O95935 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBX18O95935 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBX18O95935 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBX18O95935 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBX18O95935 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBX18O95935 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBX18O95935 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBX18O95935 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBX18O95935 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBX18O95935 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TBX18O95935 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBX18O95935 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBX18O95935 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBX18O95935 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TBX18O95935 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TBX18O95935 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TBX18O95935 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TBX18O95935 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBX18O95935 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBX18O95935 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBX18O95935 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TBX18O95935 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBX18O95935 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBX18O95935 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBX18O95935 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBX18O95935 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBX18O95935 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBX18O95935 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBX18O95935 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TBX18O95935 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TBX18O95935 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TBX18O95935 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TBX18O95935 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TBX18O95935 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TBX18O95935 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TBX18O95935 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TBX18O95935 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TBX18O95935 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TBX18O95935 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TBX18O95935 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TBX18O95935 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TBX18O95935 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TBX18O95935 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TBX18O95935 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TBX18O95935 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TBX18O95935 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TBX18O95935 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TBX18O95935 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TBX18O95935 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TBX18O95935 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TBX18O95935 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBX18O95935 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBX18O95935 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBX18O95935 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBX18O95935 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBX18O95935 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBX18O95935 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBX18O95935 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBX18O95935 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBX18O95935 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBX18O95935 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBX18O95935 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBX18O95935 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBX18O95935 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBX18O95935 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBX18O95935 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TBX18O95935 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBX18O95935 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TBX18O95935 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBX18O95935 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBX18O95935 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBX18O95935 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBX18O95935 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBX18O95935 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBX18O95935 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBX18O95935 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TBX18O95935 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TBX18O95935 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TBX18O95935 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TBX18O95935 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TBX18O95935 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TBX18O95935 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TBX18O95935 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TBX18O95935 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TBX18O95935 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TBX18O95935 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBX18O95935 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBX18O95935 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBX18O95935 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBX18O95935 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBX18O95935 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBX18O95935 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBX18O95935 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBX18O95935 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBX18O95935 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms