Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
STAMBPO95630 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STAMBPO95630 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms