Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN7O95471 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN7O95471 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms