Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCB11O95342 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCB11O95342 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms