Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIF4AO95239 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms