Protein–RNA interactions for Protein: O95197

RTN3, Reticulon-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN3O95197 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN3O95197 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN3O95197 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN3O95197 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN3O95197 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN3O95197 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN3O95197 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN3O95197 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN3O95197 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN3O95197 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN3O95197 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN3O95197 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN3O95197 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN3O95197 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN3O95197 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN3O95197 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN3O95197 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN3O95197 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN3O95197 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN3O95197 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN3O95197 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN3O95197 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN3O95197 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN3O95197 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN3O95197 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN3O95197 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN3O95197 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN3O95197 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN3O95197 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN3O95197 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN3O95197 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN3O95197 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN3O95197 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN3O95197 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN3O95197 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN3O95197 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN3O95197 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN3O95197 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN3O95197 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN3O95197 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN3O95197 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN3O95197 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN3O95197 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN3O95197 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN3O95197 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN3O95197 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN3O95197 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN3O95197 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN3O95197 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN3O95197 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN3O95197 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN3O95197 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN3O95197 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN3O95197 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN3O95197 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN3O95197 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN3O95197 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN3O95197 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN3O95197 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN3O95197 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN3O95197 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN3O95197 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN3O95197 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN3O95197 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN3O95197 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN3O95197 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN3O95197 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN3O95197 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN3O95197 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN3O95197 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN3O95197 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
RTN3O95197 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN3O95197 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN3O95197 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN3O95197 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN3O95197 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN3O95197 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN3O95197 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN3O95197 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN3O95197 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN3O95197 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN3O95197 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN3O95197 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN3O95197 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN3O95197 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN3O95197 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN3O95197 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN3O95197 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN3O95197 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN3O95197 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN3O95197 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN3O95197 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN3O95197 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN3O95197 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN3O95197 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN3O95197 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN3O95197 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN3O95197 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN3O95197 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN3O95197 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms