Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL18O94889 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL18O94889 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL18O94889 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL18O94889 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL18O94889 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL18O94889 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL18O94889 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL18O94889 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL18O94889 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL18O94889 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL18O94889 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL18O94889 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL18O94889 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL18O94889 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL18O94889 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL18O94889 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL18O94889 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL18O94889 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL18O94889 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL18O94889 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL18O94889 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL18O94889 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL18O94889 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL18O94889 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL18O94889 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL18O94889 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL18O94889 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL18O94889 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL18O94889 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL18O94889 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL18O94889 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL18O94889 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL18O94889 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL18O94889 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL18O94889 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL18O94889 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KLHL18O94889 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KLHL18O94889 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL18O94889 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms