Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCNKO75909 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCNKO75909 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCNKO75909 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCNKO75909 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNKO75909 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNKO75909 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNKO75909 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNKO75909 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNKO75909 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNKO75909 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNKO75909 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNKO75909 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNKO75909 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNKO75909 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNKO75909 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNKO75909 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNKO75909 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNKO75909 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNKO75909 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNKO75909 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNKO75909 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNKO75909 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNKO75909 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNKO75909 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNKO75909 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNKO75909 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNKO75909 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNKO75909 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNKO75909 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNKO75909 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNKO75909 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNKO75909 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNKO75909 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNKO75909 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNKO75909 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNKO75909 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNKO75909 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNKO75909 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNKO75909 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNKO75909 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNKO75909 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNKO75909 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNKO75909 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNKO75909 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNKO75909 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNKO75909 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNKO75909 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNKO75909 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNKO75909 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNKO75909 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNKO75909 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNKO75909 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNKO75909 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNKO75909 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNKO75909 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNKO75909 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNKO75909 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNKO75909 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNKO75909 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNKO75909 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNKO75909 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNKO75909 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNKO75909 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNKO75909 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNKO75909 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNKO75909 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNKO75909 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNKO75909 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNKO75909 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNKO75909 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNKO75909 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNKO75909 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNKO75909 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNKO75909 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNKO75909 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNKO75909 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNKO75909 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNKO75909 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNKO75909 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNKO75909 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNKO75909 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNKO75909 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNKO75909 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNKO75909 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCNKO75909 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCNKO75909 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCNKO75909 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNKO75909 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNKO75909 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNKO75909 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNKO75909 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNKO75909 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNKO75909 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNKO75909 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNKO75909 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNKO75909 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNKO75909 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCNKO75909 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCNKO75909 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms