Protein–RNA interactions for Protein: O75663

TIPRL, TIP41-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIPRLO75663 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
TIPRLO75663 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TIPRLO75663 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms