Protein–RNA interactions for Protein: O75367

H2AFY, Core histone macro-H2A.1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFYO75367 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2AFYO75367 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2AFYO75367 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2AFYO75367 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
H2AFYO75367 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
H2AFYO75367 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2AFYO75367 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2AFYO75367 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2AFYO75367 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2AFYO75367 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
H2AFYO75367 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2AFYO75367 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2AFYO75367 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms