Protein–RNA interactions for Protein: O75167

PHACTR2, Phosphatase and actin regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR2O75167 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHACTR2O75167 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHACTR2O75167 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms