Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.55■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.51■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RAB11FIP3O75154 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB11FIP3O75154 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms