Protein–RNA interactions for Protein: O60941

DTNB, Dystrobrevin beta, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTNBO60941 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DTNBO60941 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DTNBO60941 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DTNBO60941 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DTNBO60941 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DTNBO60941 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DTNBO60941 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DTNBO60941 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DTNBO60941 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DTNBO60941 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DTNBO60941 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DTNBO60941 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DTNBO60941 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DTNBO60941 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DTNBO60941 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DTNBO60941 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DTNBO60941 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DTNBO60941 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DTNBO60941 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DTNBO60941 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
DTNBO60941 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DTNBO60941 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DTNBO60941 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DTNBO60941 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DTNBO60941 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DTNBO60941 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DTNBO60941 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DTNBO60941 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DTNBO60941 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DTNBO60941 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DTNBO60941 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DTNBO60941 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DTNBO60941 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DTNBO60941 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DTNBO60941 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DTNBO60941 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DTNBO60941 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DTNBO60941 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DTNBO60941 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DTNBO60941 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DTNBO60941 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DTNBO60941 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
DTNBO60941 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DTNBO60941 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DTNBO60941 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DTNBO60941 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DTNBO60941 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DTNBO60941 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
DTNBO60941 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DTNBO60941 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DTNBO60941 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DTNBO60941 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DTNBO60941 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DTNBO60941 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DTNBO60941 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DTNBO60941 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DTNBO60941 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DTNBO60941 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DTNBO60941 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DTNBO60941 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DTNBO60941 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DTNBO60941 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DTNBO60941 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DTNBO60941 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
DTNBO60941 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DTNBO60941 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DTNBO60941 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DTNBO60941 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DTNBO60941 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DTNBO60941 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DTNBO60941 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DTNBO60941 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DTNBO60941 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DTNBO60941 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DTNBO60941 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DTNBO60941 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DTNBO60941 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
DTNBO60941 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DTNBO60941 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
DTNBO60941 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DTNBO60941 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DTNBO60941 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DTNBO60941 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DTNBO60941 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DTNBO60941 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DTNBO60941 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DTNBO60941 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DTNBO60941 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DTNBO60941 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DTNBO60941 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DTNBO60941 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DTNBO60941 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DTNBO60941 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DTNBO60941 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DTNBO60941 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DTNBO60941 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DTNBO60941 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DTNBO60941 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DTNBO60941 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DTNBO60941 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms