Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
ABCC9O60706 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
ABCC9O60706 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
ABCC9O60706 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.31■■■■■ 4.84
ABCC9O60706 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC45.31■■■■■ 4.84
ABCC9O60706 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC45.3■■■■■ 4.84
ABCC9O60706 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
ABCC9O60706 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
ABCC9O60706 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC45.3■■■■■ 4.84
ABCC9O60706 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC45.3■■■■■ 4.84
ABCC9O60706 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
ABCC9O60706 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
ABCC9O60706 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.29■■■■■ 4.84
ABCC9O60706 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC45.29■■■■■ 4.84
ABCC9O60706 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
ABCC9O60706 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC45.28■■■■■ 4.84
ABCC9O60706 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
ABCC9O60706 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
ABCC9O60706 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
ABCC9O60706 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
ABCC9O60706 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
ABCC9O60706 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.27■■■■■ 4.84
ABCC9O60706 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
ABCC9O60706 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
ABCC9O60706 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC45.27■■■■■ 4.84
ABCC9O60706 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.27■■■■■ 4.84
ABCC9O60706 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
ABCC9O60706 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC45.26■■■■■ 4.84
ABCC9O60706 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.26■■■■■ 4.84
ABCC9O60706 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
ABCC9O60706 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC45.26■■■■■ 4.84
ABCC9O60706 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
ABCC9O60706 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.26■■■■■ 4.84
ABCC9O60706 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
ABCC9O60706 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
ABCC9O60706 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC45.25■■■■■ 4.83
ABCC9O60706 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
ABCC9O60706 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC45.24■■■■■ 4.83
ABCC9O60706 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC45.24■■■■■ 4.83
ABCC9O60706 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC45.24■■■■■ 4.83
ABCC9O60706 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.24■■■■■ 4.83
ABCC9O60706 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
ABCC9O60706 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
ABCC9O60706 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC45.23■■■■■ 4.83
ABCC9O60706 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC45.23■■■■■ 4.83
ABCC9O60706 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
ABCC9O60706 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
ABCC9O60706 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
ABCC9O60706 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
ABCC9O60706 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC45.22■■■■■ 4.83
ABCC9O60706 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC45.22■■■■■ 4.83
ABCC9O60706 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC45.22■■■■■ 4.83
ABCC9O60706 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC45.22■■■■■ 4.83
ABCC9O60706 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
ABCC9O60706 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC45.22■■■■■ 4.83
ABCC9O60706 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
ABCC9O60706 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.21■■■■■ 4.83
ABCC9O60706 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC45.21■■■■■ 4.83
ABCC9O60706 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.21■■■■■ 4.83
ABCC9O60706 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
ABCC9O60706 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC45.21■■■■■ 4.83
ABCC9O60706 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.21■■■■■ 4.83
ABCC9O60706 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
ABCC9O60706 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
ABCC9O60706 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
ABCC9O60706 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
ABCC9O60706 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC45.2■■■■■ 4.83
ABCC9O60706 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC45.2■■■■■ 4.83
ABCC9O60706 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC45.19■■■■■ 4.82
ABCC9O60706 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC45.19■■■■■ 4.82
ABCC9O60706 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.18■■■■■ 4.82
ABCC9O60706 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
ABCC9O60706 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.18■■■■■ 4.82
ABCC9O60706 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
ABCC9O60706 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
ABCC9O60706 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
ABCC9O60706 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
ABCC9O60706 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC45.17■■■■■ 4.82
ABCC9O60706 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC45.17■■■■■ 4.82
ABCC9O60706 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC45.17■■■■■ 4.82
ABCC9O60706 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
ABCC9O60706 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC45.16■■■■■ 4.82
ABCC9O60706 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
ABCC9O60706 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC45.16■■■■■ 4.82
ABCC9O60706 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC45.16■■■■■ 4.82
ABCC9O60706 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
ABCC9O60706 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
ABCC9O60706 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC45.16■■■■■ 4.82
ABCC9O60706 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
ABCC9O60706 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
ABCC9O60706 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
ABCC9O60706 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.15■■■■■ 4.82
ABCC9O60706 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
ABCC9O60706 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC45.15■■■■■ 4.82
ABCC9O60706 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
ABCC9O60706 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC45.14■■■■■ 4.82
ABCC9O60706 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC45.14■■■■■ 4.82
ABCC9O60706 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
ABCC9O60706 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC45.14■■■■■ 4.82
ABCC9O60706 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms