Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLR5O60602 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLR5O60602 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLR5O60602 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLR5O60602 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLR5O60602 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLR5O60602 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLR5O60602 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLR5O60602 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLR5O60602 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLR5O60602 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLR5O60602 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TLR5O60602 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLR5O60602 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLR5O60602 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLR5O60602 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLR5O60602 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLR5O60602 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLR5O60602 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLR5O60602 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLR5O60602 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLR5O60602 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLR5O60602 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLR5O60602 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLR5O60602 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLR5O60602 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLR5O60602 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLR5O60602 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLR5O60602 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLR5O60602 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLR5O60602 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLR5O60602 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLR5O60602 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLR5O60602 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLR5O60602 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLR5O60602 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLR5O60602 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLR5O60602 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLR5O60602 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLR5O60602 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLR5O60602 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLR5O60602 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLR5O60602 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLR5O60602 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLR5O60602 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLR5O60602 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLR5O60602 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLR5O60602 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLR5O60602 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLR5O60602 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLR5O60602 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLR5O60602 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLR5O60602 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLR5O60602 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLR5O60602 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLR5O60602 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLR5O60602 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLR5O60602 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLR5O60602 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLR5O60602 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLR5O60602 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLR5O60602 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TLR5O60602 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLR5O60602 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLR5O60602 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLR5O60602 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLR5O60602 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLR5O60602 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLR5O60602 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLR5O60602 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLR5O60602 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TLR5O60602 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TLR5O60602 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TLR5O60602 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TLR5O60602 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TLR5O60602 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TLR5O60602 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TLR5O60602 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TLR5O60602 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TLR5O60602 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TLR5O60602 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TLR5O60602 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLR5O60602 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLR5O60602 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLR5O60602 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLR5O60602 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLR5O60602 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLR5O60602 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLR5O60602 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLR5O60602 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLR5O60602 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLR5O60602 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TLR5O60602 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TLR5O60602 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TLR5O60602 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TLR5O60602 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TLR5O60602 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TLR5O60602 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TLR5O60602 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TLR5O60602 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms