Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BNIP3LO60238 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms