Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDIL3O43854 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDIL3O43854 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDIL3O43854 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDIL3O43854 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDIL3O43854 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms