Protein–RNA interactions for Protein: O43824

GTPBP6, Putative GTP-binding protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP6O43824 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTPBP6O43824 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTPBP6O43824 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTPBP6O43824 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTPBP6O43824 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTPBP6O43824 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTPBP6O43824 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTPBP6O43824 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTPBP6O43824 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTPBP6O43824 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTPBP6O43824 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTPBP6O43824 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTPBP6O43824 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTPBP6O43824 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTPBP6O43824 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTPBP6O43824 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTPBP6O43824 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTPBP6O43824 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTPBP6O43824 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTPBP6O43824 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTPBP6O43824 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GTPBP6O43824 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTPBP6O43824 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTPBP6O43824 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTPBP6O43824 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTPBP6O43824 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTPBP6O43824 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTPBP6O43824 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTPBP6O43824 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTPBP6O43824 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTPBP6O43824 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTPBP6O43824 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms