Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LANCL1O43813 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LANCL1O43813 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms