Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR3O43761 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNGR3O43761 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNGR3O43761 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNGR3O43761 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNGR3O43761 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNGR3O43761 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNGR3O43761 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNGR3O43761 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNGR3O43761 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNGR3O43761 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNGR3O43761 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNGR3O43761 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNGR3O43761 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNGR3O43761 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNGR3O43761 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNGR3O43761 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNGR3O43761 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNGR3O43761 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNGR3O43761 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNGR3O43761 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNGR3O43761 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNGR3O43761 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNGR3O43761 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNGR3O43761 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNGR3O43761 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNGR3O43761 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNGR3O43761 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNGR3O43761 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNGR3O43761 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYNGR3O43761 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms