Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRKAB2O43741 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKAB2O43741 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms