Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAPPC3O43617 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC3O43617 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC3O43617 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms